Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc58Q8R3Q6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc58Q8R3Q6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc58Q8R3Q6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms