Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc12Q8R344 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc12Q8R344 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc12Q8R344 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc12Q8R344 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc12Q8R344 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc12Q8R344 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc12Q8R344 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms