Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc59Q8R2N0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc59Q8R2N0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc59Q8R2N0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc59Q8R2N0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc59Q8R2N0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc59Q8R2N0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms