Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6Q8K3P5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot6Q8K3P5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot6Q8K3P5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnot6Q8K3P5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnot6Q8K3P5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot6Q8K3P5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms