Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34c1Q8K193 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34c1Q8K193 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Cldn34c1Q8K193 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c1Q8K193 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34c1Q8K193 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms