Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot3Q8K0V4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot3Q8K0V4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot3Q8K0V4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot3Q8K0V4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot3Q8K0V4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnot3Q8K0V4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot3Q8K0V4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot3Q8K0V4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms