Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms