Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps50Q8CI71 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps50Q8CI71 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps50Q8CI71 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps50Q8CI71 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps50Q8CI71 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms