Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc87Q8CDL9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc87Q8CDL9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc87Q8CDL9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc87Q8CDL9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc87Q8CDL9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms