Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc142Q8CAI1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc142Q8CAI1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc142Q8CAI1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc142Q8CAI1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc142Q8CAI1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc142Q8CAI1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc142Q8CAI1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc142Q8CAI1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc142Q8CAI1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc142Q8CAI1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc142Q8CAI1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc142Q8CAI1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc142Q8CAI1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms