Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rccd1Q8BTU7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rccd1Q8BTU7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rccd1Q8BTU7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rccd1Q8BTU7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rccd1Q8BTU7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rccd1Q8BTU7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms