Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTG7

Ndrg4, Protein NDRG4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg4Q8BTG7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndrg4Q8BTG7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndrg4Q8BTG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndrg4Q8BTG7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndrg4Q8BTG7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndrg4Q8BTG7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndrg4Q8BTG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndrg4Q8BTG7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndrg4Q8BTG7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg4Q8BTG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndrg4Q8BTG7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndrg4Q8BTG7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms