Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN58

Arhgap28, Rho GTPase-activating protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap28Q8BN58 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap28Q8BN58 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap28Q8BN58 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap28Q8BN58 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arhgap28Q8BN58 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap28Q8BN58 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap28Q8BN58 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap28Q8BN58 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms