Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd3Q8BHD4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd3Q8BHD4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd3Q8BHD4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd3Q8BHD4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms