Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pknox2Q8BG99 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pknox2Q8BG99 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pknox2Q8BG99 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pknox2Q8BG99 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms