Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG17

Nol12, Nucleolar protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol12Q8BG17 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nol12Q8BG17 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nol12Q8BG17 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nol12Q8BG17 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nol12Q8BG17 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nol12Q8BG17 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nol12Q8BG17 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nol12Q8BG17 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nol12Q8BG17 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nol12Q8BG17 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nol12Q8BG17 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nol12Q8BG17 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nol12Q8BG17 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms