Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Kdm5bQ80Y84 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Kdm5bQ80Y84 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Kdm5bQ80Y84 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Kdm5bQ80Y84 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Kdm5bQ80Y84 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Kdm5bQ80Y84 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm5bQ80Y84 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Kdm5bQ80Y84 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Kdm5bQ80Y84 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm5bQ80Y84 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm5bQ80Y84 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm5bQ80Y84 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm5bQ80Y84 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Kdm5bQ80Y84 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Kdm5bQ80Y84 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Kdm5bQ80Y84 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Kdm5bQ80Y84 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Kdm5bQ80Y84 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Kdm5bQ80Y84 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Kdm5bQ80Y84 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Kdm5bQ80Y84 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Kdm5bQ80Y84 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Kdm5bQ80Y84 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5bQ80Y84 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Kdm5bQ80Y84 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Kdm5bQ80Y84 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Kdm5bQ80Y84 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Kdm5bQ80Y84 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Kdm5bQ80Y84 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Kdm5bQ80Y84 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5bQ80Y84 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5bQ80Y84 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5bQ80Y84 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5bQ80Y84 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
Kdm5bQ80Y84 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Kdm5bQ80Y84 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5bQ80Y84 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5bQ80Y84 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5bQ80Y84 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Kdm5bQ80Y84 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Kdm5bQ80Y84 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Kdm5bQ80Y84 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Kdm5bQ80Y84 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms