Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnih3Q6ZWS4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnih3Q6ZWS4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnih3Q6ZWS4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih3Q6ZWS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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