Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Igsf3Q6ZQA6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Igsf3Q6ZQA6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igsf3Q6ZQA6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Igsf3Q6ZQA6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms