Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rundc3bQ6PDC0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rundc3bQ6PDC0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc3bQ6PDC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc3bQ6PDC0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc3bQ6PDC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms