Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arhgap20Q6IFT4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap20Q6IFT4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap20Q6IFT4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap20Q6IFT4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap20Q6IFT4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap20Q6IFT4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap20Q6IFT4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap20Q6IFT4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap20Q6IFT4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap20Q6IFT4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap20Q6IFT4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arhgap20Q6IFT4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap20Q6IFT4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms