Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud6aQ6IE21 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6aQ6IE21 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6aQ6IE21 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud6aQ6IE21 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms