Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msl2Q69ZF8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msl2Q69ZF8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msl2Q69ZF8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msl2Q69ZF8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msl2Q69ZF8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Msl2Q69ZF8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msl2Q69ZF8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msl2Q69ZF8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msl2Q69ZF8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msl2Q69ZF8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms