Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3ipQ68EF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3ipQ68EF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab3ipQ68EF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3ipQ68EF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3ipQ68EF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms