Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80dQ66JY2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80dQ66JY2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80dQ66JY2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80dQ66JY2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80dQ66JY2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms