Protein–RNA interactions for Protein: Q64702

Plk4, Serine/threonine-protein kinase PLK4, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plk4Q64702 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plk4Q64702 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plk4Q64702 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plk4Q64702 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plk4Q64702 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plk4Q64702 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plk4Q64702 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plk4Q64702 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms