Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atp7bQ64446 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atp7bQ64446 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atp7bQ64446 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atp7bQ64446 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atp7bQ64446 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Atp7bQ64446 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atp7bQ64446 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atp7bQ64446 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atp7bQ64446 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atp7bQ64446 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp7bQ64446 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp7bQ64446 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp7bQ64446 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp7bQ64446 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp7bQ64446 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp7bQ64446 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp7bQ64446 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp7bQ64446 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp7bQ64446 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp7bQ64446 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp7bQ64446 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Atp7bQ64446 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Atp7bQ64446 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Atp7bQ64446 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Atp7bQ64446 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atp7bQ64446 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atp7bQ64446 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atp7bQ64446 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atp7bQ64446 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atp7bQ64446 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp7bQ64446 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Atp7bQ64446 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atp7bQ64446 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atp7bQ64446 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atp7bQ64446 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atp7bQ64446 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atp7bQ64446 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp7bQ64446 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp7bQ64446 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp7bQ64446 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Atp7bQ64446 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atp7bQ64446 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms