Protein–RNA interactions for Protein: Q62193

Rpa2, Replication protein A 32 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa2Q62193 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa2Q62193 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpa2Q62193 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpa2Q62193 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpa2Q62193 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa2Q62193 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa2Q62193 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa2Q62193 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa2Q62193 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpa2Q62193 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpa2Q62193 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpa2Q62193 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpa2Q62193 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa2Q62193 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms