Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifi47Q61635 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ifi47Q61635 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi47Q61635 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifi47Q61635 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifi47Q61635 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms