Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp4Q61107 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp4Q61107 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp4Q61107 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp4Q61107 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp4Q61107 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms