Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb6Q60692 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb6Q60692 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb6Q60692 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb6Q60692 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb6Q60692 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms