Protein–RNA interactions for Protein: Q60675

Lama2, Laminin subunit alpha-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama2Q60675 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lama2Q60675 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lama2Q60675 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lama2Q60675 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lama2Q60675 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms