Protein–RNA interactions for Protein: Q60675

Lama2, Laminin subunit alpha-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama2Q60675 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lama2Q60675 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lama2Q60675 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lama2Q60675 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama2Q60675 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lama2Q60675 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lama2Q60675 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lama2Q60675 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama2Q60675 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lama2Q60675 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lama2Q60675 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lama2Q60675 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lama2Q60675 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms