Protein–RNA interactions for Protein: Q5U405

Tmprss13, Transmembrane protease serine 13, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss13Q5U405 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmprss13Q5U405 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmprss13Q5U405 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmprss13Q5U405 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmprss13Q5U405 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmprss13Q5U405 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms