Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NkaplQ5SZT7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NkaplQ5SZT7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkaplQ5SZT7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkaplQ5SZT7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkaplQ5SZT7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NkaplQ5SZT7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NkaplQ5SZT7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NkaplQ5SZT7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NkaplQ5SZT7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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