Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf145Q5SWK7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf145Q5SWK7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf145Q5SWK7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf145Q5SWK7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf145Q5SWK7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf145Q5SWK7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf145Q5SWK7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf145Q5SWK7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf145Q5SWK7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf145Q5SWK7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf145Q5SWK7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf145Q5SWK7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf145Q5SWK7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms