Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsr1Q5SWD9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tsr1Q5SWD9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tsr1Q5SWD9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsr1Q5SWD9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tsr1Q5SWD9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tsr1Q5SWD9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsr1Q5SWD9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms