Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a5Q5RJI2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a5Q5RJI2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a5Q5RJI2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a5Q5RJI2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc44a5Q5RJI2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms