Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RilpQ5ND29 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RilpQ5ND29 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RilpQ5ND29 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RilpQ5ND29 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RilpQ5ND29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms