Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Taf3Q5HZG4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Taf3Q5HZG4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Taf3Q5HZG4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Taf3Q5HZG4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Taf3Q5HZG4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf3Q5HZG4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms