Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp13Q5BKP2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp13Q5BKP2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp13Q5BKP2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp13Q5BKP2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp13Q5BKP2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp13Q5BKP2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp13Q5BKP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms