Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufaf2Q59J78 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufaf2Q59J78 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufaf2Q59J78 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufaf2Q59J78 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufaf2Q59J78 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufaf2Q59J78 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufaf2Q59J78 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufaf2Q59J78 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndufaf2Q59J78 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufaf2Q59J78 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufaf2Q59J78 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf2Q59J78 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndufaf2Q59J78 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufaf2Q59J78 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufaf2Q59J78 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufaf2Q59J78 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufaf2Q59J78 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufaf2Q59J78 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms