Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srrm1Q52KI8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srrm1Q52KI8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srrm1Q52KI8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srrm1Q52KI8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srrm1Q52KI8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srrm1Q52KI8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srrm1Q52KI8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srrm1Q52KI8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srrm1Q52KI8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Srrm1Q52KI8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Srrm1Q52KI8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Srrm1Q52KI8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srrm1Q52KI8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srrm1Q52KI8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srrm1Q52KI8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms