Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4bQ3UW98 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4bQ3UW98 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4bQ3UW98 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca4bQ3UW98 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4bQ3UW98 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4bQ3UW98 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4bQ3UW98 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4bQ3UW98 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4bQ3UW98 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clca4bQ3UW98 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca4bQ3UW98 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca4bQ3UW98 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4bQ3UW98 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4bQ3UW98 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms