Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkain3Q3URJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkain3Q3URJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkain3Q3URJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkain3Q3URJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkain3Q3URJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkain3Q3URJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms