Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL6

Ms4a15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a15Q3UPL6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a15Q3UPL6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a15Q3UPL6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a15Q3UPL6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a15Q3UPL6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a15Q3UPL6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a15Q3UPL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ms4a15Q3UPL6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ms4a15Q3UPL6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a15Q3UPL6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a15Q3UPL6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a15Q3UPL6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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