Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp19Q3UJD6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp19Q3UJD6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp19Q3UJD6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp19Q3UJD6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Usp19Q3UJD6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Usp19Q3UJD6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Usp19Q3UJD6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp19Q3UJD6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp19Q3UJD6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp19Q3UJD6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp19Q3UJD6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp19Q3UJD6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp19Q3UJD6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Usp19Q3UJD6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Usp19Q3UJD6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp19Q3UJD6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp19Q3UJD6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Usp19Q3UJD6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp19Q3UJD6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp19Q3UJD6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp19Q3UJD6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp19Q3UJD6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp19Q3UJD6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp19Q3UJD6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Usp19Q3UJD6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Usp19Q3UJD6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Usp19Q3UJD6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Usp19Q3UJD6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Usp19Q3UJD6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp19Q3UJD6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp19Q3UJD6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp19Q3UJD6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp19Q3UJD6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Usp19Q3UJD6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms