Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slc10a4Q3UEZ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc10a4Q3UEZ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc10a4Q3UEZ8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc10a4Q3UEZ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc10a4Q3UEZ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc10a4Q3UEZ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc10a4Q3UEZ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc10a4Q3UEZ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc10a4Q3UEZ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc10a4Q3UEZ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc10a4Q3UEZ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc10a4Q3UEZ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc10a4Q3UEZ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc10a4Q3UEZ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc10a4Q3UEZ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc10a4Q3UEZ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc10a4Q3UEZ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc10a4Q3UEZ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slc10a4Q3UEZ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc10a4Q3UEZ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc10a4Q3UEZ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc10a4Q3UEZ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc10a4Q3UEZ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc10a4Q3UEZ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc10a4Q3UEZ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc10a4Q3UEZ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms