Protein–RNA interactions for Protein: Q3UCV8

Otulin, Ubiquitin thioesterase otulin, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtulinQ3UCV8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OtulinQ3UCV8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OtulinQ3UCV8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OtulinQ3UCV8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OtulinQ3UCV8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OtulinQ3UCV8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OtulinQ3UCV8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OtulinQ3UCV8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OtulinQ3UCV8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OtulinQ3UCV8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OtulinQ3UCV8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OtulinQ3UCV8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OtulinQ3UCV8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OtulinQ3UCV8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OtulinQ3UCV8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OtulinQ3UCV8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OtulinQ3UCV8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OtulinQ3UCV8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms