Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf149Q3U2C5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf149Q3U2C5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf149Q3U2C5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf149Q3U2C5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf149Q3U2C5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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