Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrn4clQ3TYX2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrn4clQ3TYX2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrn4clQ3TYX2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrn4clQ3TYX2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrn4clQ3TYX2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrn4clQ3TYX2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrn4clQ3TYX2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrn4clQ3TYX2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrn4clQ3TYX2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms